178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5196 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
137 aa  274  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  46.51 
 
 
138 aa  128  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  54.03 
 
 
158 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  50.39 
 
 
144 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  48.8 
 
 
147 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  51.2 
 
 
152 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  50.78 
 
 
141 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  48.8 
 
 
147 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  48.8 
 
 
147 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 
147 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  48 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  48 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  48.06 
 
 
144 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  52.24 
 
 
136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  48.44 
 
 
147 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  46.09 
 
 
147 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  48.44 
 
 
177 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  48.44 
 
 
177 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  48.44 
 
 
177 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  48.44 
 
 
238 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  46.88 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  48.44 
 
 
248 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  48.44 
 
 
374 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  46.03 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  43.2 
 
 
213 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  37.98 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  44.64 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  36.97 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  34.65 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  40.16 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  36.13 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  36.13 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2571  hypothetical protein  47.69 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163005  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  33.86 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  33.06 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  34.23 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  36.89 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  34.45 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  33.9 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  37.62 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  33.98 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  36.75 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  35.59 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  35.24 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 
138 aa  57  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  37.82 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 
169 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  38.6 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  31.78 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  36.63 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  32.52 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  34.17 
 
 
151 aa  53.5  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 
146 aa  53.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  34.75 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  34.75 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  34.75 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  35.83 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  29.71 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1582  phenylacetic acid degradation-like protein  33.94 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000511967  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  32.99 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  33.65 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  31.48 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
155 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  34.65 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  31.16 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  35.56 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  27.52 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  32.26 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  32.2 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 
163 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 
154 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
139 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  32.98 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  34 
 
 
153 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  31.63 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  25.44 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>