221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5230 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
157 aa  320  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  51.47 
 
 
141 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  51.85 
 
 
158 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  49.24 
 
 
144 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  51.18 
 
 
138 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  49.24 
 
 
374 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  49.24 
 
 
248 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  49.24 
 
 
238 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  49.24 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  49.24 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  49.24 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  49.24 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  46.97 
 
 
144 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  46.21 
 
 
147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  46.21 
 
 
147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  46.21 
 
 
147 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  47.01 
 
 
148 aa  127  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  44.7 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  44.7 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  46.88 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  41.09 
 
 
166 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 
213 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  44.27 
 
 
136 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  35.43 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  34.88 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  36.3 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  35 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  33.86 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  34.45 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  35.94 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  34.92 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  30.6 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  33.07 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  33.07 
 
 
185 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  36.89 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  35.9 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  29.66 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  31.58 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  28.06 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  28.68 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.8 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 
128 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  33.01 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2571  hypothetical protein  46.03 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163005  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  35.16 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  32.77 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  28.36 
 
 
146 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.29 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.61 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  28.46 
 
 
142 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  30.94 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  29.27 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  24.24 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  24.6 
 
 
155 aa  50.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3025  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0281155  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  29.33 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.66 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.66 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  30.07 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  29.13 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.43 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.34 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  32.99 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.5 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  32.99 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  31.93 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  32.99 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  26.77 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.7 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  30.16 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>