152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4384 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  296  6e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  55.3 
 
 
166 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  41.72 
 
 
213 aa  100  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  42.75 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  40.31 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0341  hypothetical protein  78.57 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 
144 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  35.2 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  35.25 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
138 aa  84.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  34.43 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  34.43 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  34.43 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  35.59 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  36.07 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  35.82 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  39.34 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  35.82 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  35.82 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  36.07 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  36.07 
 
 
248 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  38.6 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  41.59 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  36.07 
 
 
374 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  34.01 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  47.67 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  39.47 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  38.84 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  38.1 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  36.84 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  35.96 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  45.35 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  45.35 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  37.21 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  31.01 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  32.88 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  34 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  31.58 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  31.88 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  31.58 
 
 
185 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  27.43 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  43.02 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  36.09 
 
 
163 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  33.61 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  36 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  32.23 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  35.2 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  35.2 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  34.4 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  32.58 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  35.09 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  33.67 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
169 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  35.2 
 
 
160 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  32.65 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  35.2 
 
 
160 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  35.2 
 
 
160 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  35.2 
 
 
160 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  35.2 
 
 
160 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  35.2 
 
 
160 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  35.2 
 
 
160 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  35.2 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
139 aa  52  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
134 aa  52  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.58 
 
 
150 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  33.66 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  37.78 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.65 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  32.69 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.45 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.65 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  34.26 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.47 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  33.02 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>