184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1902 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 163 aa  326  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  47.89 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  38.24 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  35.92 
 
 		 185 aa  94.7  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  35.92 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  35.21 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  42.61 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  41.56 
 
 		 213 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  37.4 
 
 		 146 aa  90.9  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  39.47 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  35.46 
 
 		 152 aa  87.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  34.67 
 
 		 148 aa  87  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  41.67 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  43.14 
 
 		 132 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  37.61 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  37.9 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  35.78 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  39.84 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  35.61 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  28.15 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  34.03 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  35.61 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  30.3 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  34.69 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  33.08 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  33.86 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  35.71 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  28.21 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  37.86 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  22.96 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  32.76 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  34.12 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  27.97 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  38.37 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  36.99 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  26.23 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  33.58 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  28.81 
 
 		 136 aa  50.8  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  27.12 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  29.23 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  35.09 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  30.17 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  34.02 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  30.17 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  31.03 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  30.17 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  32.33 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  29.11 
 
 		 238 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  25.35 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  35 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  28.93 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  28.93 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  28.93 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  33.01 
 
 		 191 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  34 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  29.81 
 
 		 177 aa  47.4  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  28.68 
 
 		 137 aa  47.4  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  29.81 
 
 		 177 aa  47.4  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  29.81 
 
 		 177 aa  47.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  29.21 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  28.29 
 
 		 374 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  28.48 
 
 		 248 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  32.93 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>