More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1955 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  312  9e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  46.04 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  50.39 
 
 
147 aa  124  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  48.06 
 
 
147 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  49.23 
 
 
146 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  46.48 
 
 
154 aa  120  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  44.06 
 
 
153 aa  120  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  43.18 
 
 
158 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0328  thioesterase superfamily protein  46.4 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  39.78 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  32.09 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  30.95 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  33.64 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  33.64 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  33.64 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  29.69 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  32.71 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  30 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
183 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  29.85 
 
 
191 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  33.33 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  32.22 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  35.23 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  28.06 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  32.82 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  35.06 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  35.06 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  35.06 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  35.06 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  30.84 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  35.06 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  35.06 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  35.06 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  33.7 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  35.06 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
159 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  41.56 
 
 
142 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 
138 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 
134 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
161 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  38.75 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  30.14 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  37.89 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.36 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.15 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  28.8 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.15 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.15 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  36.59 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.09 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.62 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  29.91 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  29.91 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  29.91 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  29.91 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  29.91 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  29.91 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  29.91 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.51 
 
 
178 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  32.1 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  28.57 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.59 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  33.7 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  37.5 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  33.7 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  33.7 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  28.89 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0963  hypothetical protein  34.94 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000957659  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  30.25 
 
 
195 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0944  hypothetical protein  34.94 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00659595  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>