210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0749 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  283  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  59.12 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  56.83 
 
 		 151 aa  163  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  46.97 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  46.77 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  46.62 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  33.72 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  36.59 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  30.82 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  39.02 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  36.59 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  35.37 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  31.03 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  29.66 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  34.51 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  35.16 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  30.33 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  31.97 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  34.23 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  36.17 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  29.17 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  35.51 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  29.51 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  31.71 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  30.95 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  30.95 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  29.51 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  29.51 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  30.39 
 
 		 335 aa  53.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  30.97 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  29.09 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  31.73 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  30.08 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  27.87 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  31.97 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  31.15 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  31.15 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  31.15 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  27.87 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  31.15 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  27.87 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  28.69 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  31.15 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  30.33 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  30.33 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  30.33 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  30.33 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  30.33 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  37.78 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  30.33 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  35.42 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  30.33 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2124  thioesterase superfamily protein  36.56 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  29.35 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  30.33 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 175 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 175 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 175 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 175 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  31.13 
 
 		 180 aa  51.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  25.19 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  27.73 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 167 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  29.51 
 
 		 329 aa  50.1  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  34.38 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.65 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  33.01 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  30.19 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  25.2 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  29.25 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  34.07 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  28.33 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  36.17 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.89 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  27.5 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  30.56 
 
 		 319 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  32.91 
 
 		 304 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  26.67 
 
 		 162 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  35.62 
 
 		 295 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>