279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0253 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  328  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  46.84 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  49.3 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  47.18 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  46.36 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  45.95 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  48.59 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  49.3 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  49.3 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  49.3 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  46.36 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  46.36 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  46.36 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  45.7 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  44.37 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  46.26 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  44.59 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  44.37 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  44.37 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  44.37 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  44.37 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  44.37 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  44.37 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  44.37 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  44.37 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  45.39 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  44.52 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  43.05 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  41.94 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  43.71 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  43.71 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  43.71 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  44.16 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  43.71 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  43.71 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  41.56 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  42.28 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  41.14 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  36.99 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  38.13 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  35.4 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  37.14 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  36.88 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  35 
 
 		 160 aa  90.5  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  34.76 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  33.99 
 
 		 188 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  29.38 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  31.76 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  34.9 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  34.23 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  34 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  28.86 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  31.61 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  28.78 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  28.78 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  28.48 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  32.59 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  27.81 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  35.2 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  28.26 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  29.1 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  27.4 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  28.99 
 
 		 329 aa  61.6  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  32.89 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  36.36 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  24.69 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  30.07 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  26.87 
 
 		 334 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 		 332 aa  57.4  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  27.21 
 
 		 301 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 		 168 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  26.12 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  30.71 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  29.91 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  27.39 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>