88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1552 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  357  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  72.73 
 
 		 168 aa  248  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  72.12 
 
 		 168 aa  246  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  72.12 
 
 		 168 aa  246  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  67.88 
 
 		 167 aa  243  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  67.47 
 
 		 173 aa  241  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  66.26 
 
 		 167 aa  228  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  45.58 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  39.63 
 
 		 329 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 154 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 154 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 154 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  40.14 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  40.14 
 
 		 335 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  40.54 
 
 		 139 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  38.73 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  38.96 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  118  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 		 332 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  35.9 
 
 		 334 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  38.73 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  39.46 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  36.2 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  39.86 
 
 		 148 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  36.2 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  36.2 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  37.66 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  38.57 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  42.47 
 
 		 301 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  33.54 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  34.72 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  34.03 
 
 		 163 aa  85.1  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 		 304 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  33.79 
 
 		 295 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  34.81 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  29.66 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  36.36 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  27.89 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  30.5 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  28.05 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  25 
 
 		 140 aa  51.2  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  27.21 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  30.26 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  28.93 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  24.55 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  28 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  24.83 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  27.07 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  29.17 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  28.29 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  29.68 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  25.85 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  28.57 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  28.57 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  28.57 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  26.32 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  26.32 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  26.57 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  22.76 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  28.77 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  30.72 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  29.1 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 		 159 aa  42  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  27.89 
 
 		 154 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 143 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  29.66 
 
 		 154 aa  41.2  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  24.84 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  26.09 
 
 		 180 aa  40.8  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  27.69 
 
 		 154 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  27.69 
 
 		 154 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>