97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3680 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  310  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  92.57 
 
 
148 aa  295  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  84.46 
 
 
148 aa  270  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  74.13 
 
 
150 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  70.55 
 
 
160 aa  217  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  70.55 
 
 
160 aa  216  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  70.55 
 
 
160 aa  216  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  67.81 
 
 
160 aa  206  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  58.16 
 
 
334 aa  191  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  59.57 
 
 
155 aa  189  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  57.45 
 
 
332 aa  187  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 
165 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 
165 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 
168 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 
165 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  57.93 
 
 
147 aa  186  7e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  55.17 
 
 
335 aa  186  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 
165 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  56.34 
 
 
154 aa  186  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  56.03 
 
 
159 aa  185  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 
154 aa  184  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 
154 aa  184  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 
154 aa  184  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  56.55 
 
 
329 aa  184  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  55 
 
 
144 aa  178  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  46.26 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  46.72 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 
150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 
173 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  44.7 
 
 
145 aa  117  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  45.9 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  41.33 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  40.52 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  39.87 
 
 
168 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  39.87 
 
 
168 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  37.66 
 
 
172 aa  105  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  38.82 
 
 
167 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  42.02 
 
 
141 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  36.64 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  37.4 
 
 
163 aa  97.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  39.37 
 
 
301 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  40.32 
 
 
295 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 
304 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  39.02 
 
 
319 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  34.4 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  32.77 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  30.23 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  32.17 
 
 
167 aa  62  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  30.07 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 
158 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 
158 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  27.59 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
233 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  24.6 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  25.98 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  25.98 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
150 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  27.66 
 
 
180 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  27.13 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  26.45 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  31.34 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  27.41 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  32.14 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  24.66 
 
 
175 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  24.66 
 
 
175 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  24.66 
 
 
175 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  24.66 
 
 
175 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  29.1 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  29.1 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  29.1 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  32.14 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  27.52 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  25.69 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  26.4 
 
 
155 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  25.69 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  30.11 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  25.69 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  26.92 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  32.14 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  28.43 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  27.45 
 
 
157 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  27.19 
 
 
188 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  30.69 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  23.85 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  26.28 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  25.49 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  26.28 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>