139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3681 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  323  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  94.9 
 
 
157 aa  312  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  79.87 
 
 
159 aa  266  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  69.43 
 
 
178 aa  235  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  66.44 
 
 
158 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  66.44 
 
 
158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  65.75 
 
 
158 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  65.75 
 
 
158 aa  213  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  57.86 
 
 
180 aa  169  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  56.43 
 
 
169 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  55 
 
 
165 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  54.73 
 
 
329 aa  164  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  54.29 
 
 
175 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  53.55 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  50.64 
 
 
175 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  50.64 
 
 
175 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  50.64 
 
 
175 aa  161  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  53.57 
 
 
335 aa  161  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  53.57 
 
 
334 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  50.64 
 
 
175 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  50.64 
 
 
175 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  50.64 
 
 
175 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  50.64 
 
 
175 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 
332 aa  157  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 
168 aa  150  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  50.42 
 
 
233 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  44.36 
 
 
152 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  42.96 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  46.09 
 
 
167 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  40.71 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  37.41 
 
 
167 aa  107  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  39.37 
 
 
163 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  38.97 
 
 
140 aa  104  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  38.58 
 
 
163 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 
158 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  36.64 
 
 
319 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  38.28 
 
 
144 aa  94.4  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  41.41 
 
 
301 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  36.13 
 
 
295 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 
304 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  31.65 
 
 
167 aa  90.5  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  33.61 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  35.58 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  30.16 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  25.36 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 
173 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  34.04 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  27.2 
 
 
157 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  28 
 
 
157 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  29.47 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
139 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  24.03 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  24.81 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  29.76 
 
 
138 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
144 aa  47.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  28.28 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  27.07 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  25.34 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  33.01 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  31.82 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  25.34 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  31.18 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  28.43 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  28.43 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  26.72 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  26.27 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  23.68 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  24.62 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  27.03 
 
 
188 aa  44.3  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  23.85 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  30.12 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  30.11 
 
 
141 aa  43.9  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  26.47 
 
 
153 aa  43.9  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
165 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  24.83 
 
 
167 aa  43.9  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
127 aa  43.9  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  25.62 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  26.47 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  32 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  26.27 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>