112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1800 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
165 aa  343  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  99.39 
 
 
165 aa  343  8e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  99.39 
 
 
165 aa  343  8e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  98.79 
 
 
165 aa  340  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  97.4 
 
 
335 aa  315  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  97.9 
 
 
154 aa  296  6e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  97.9 
 
 
154 aa  296  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  97.9 
 
 
154 aa  296  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  97.2 
 
 
159 aa  296  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  90.21 
 
 
168 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  81.94 
 
 
329 aa  273  8e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  78.26 
 
 
334 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  86.01 
 
 
332 aa  270  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  85.31 
 
 
154 aa  266  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  80.27 
 
 
147 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  81.82 
 
 
155 aa  263  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  59.42 
 
 
144 aa  194  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  55.17 
 
 
148 aa  187  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  55.17 
 
 
148 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  56.94 
 
 
160 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 
148 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  54.86 
 
 
160 aa  176  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  54.86 
 
 
160 aa  176  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 
150 aa  176  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  54.86 
 
 
160 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
139 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  52 
 
 
150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 
144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  43.66 
 
 
173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  41.5 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 
168 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  40.43 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  42.03 
 
 
152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  40.43 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  40.14 
 
 
172 aa  123  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
145 aa  123  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 
167 aa  121  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  36.43 
 
 
163 aa  111  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  40.65 
 
 
141 aa  110  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  34.29 
 
 
163 aa  110  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  39.53 
 
 
301 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 
304 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  36.07 
 
 
295 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 
128 aa  92.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  35.9 
 
 
319 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  34.96 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  26.87 
 
 
157 aa  57.8  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
138 aa  57.4  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  28.24 
 
 
167 aa  57.4  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  24.24 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  29.92 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
233 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  27.27 
 
 
138 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  25.93 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  29.2 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  29.2 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  29.2 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  24.43 
 
 
163 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  27.42 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  23.66 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  25.93 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  24.62 
 
 
140 aa  48.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  23.7 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  26.67 
 
 
162 aa  48.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  25.6 
 
 
135 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  26.4 
 
 
178 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  21.05 
 
 
137 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  25.15 
 
 
161 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  27.01 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  27.01 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  24.8 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  30.61 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  27.01 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  25.15 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  27.01 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  27.01 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  25.15 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  29.58 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  24.82 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  23.36 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  24.75 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  23.31 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  24.44 
 
 
155 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  24 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  24 
 
 
158 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  27.27 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  23.85 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  30.61 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  24 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  27.13 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  26.61 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  25.93 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  26.09 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  26.09 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>