192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0390 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  313  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  88.96 
 
 		 154 aa  288  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  88.31 
 
 		 154 aa  286  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  88.31 
 
 		 154 aa  286  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  87.66 
 
 		 154 aa  285  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  88.96 
 
 		 154 aa  285  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  87.66 
 
 		 154 aa  285  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  87.66 
 
 		 154 aa  285  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  86.36 
 
 		 154 aa  284  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  87.66 
 
 		 154 aa  284  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  87.66 
 
 		 154 aa  283  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  83.12 
 
 		 154 aa  269  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  82.47 
 
 		 154 aa  265  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  80.52 
 
 		 154 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  81.17 
 
 		 154 aa  262  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  49.32 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  49.32 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  49.32 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  49.32 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  49.32 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  47.97 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  47.97 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  47.97 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  47.97 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  47.97 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  47.97 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  50.32 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  47.97 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  47.3 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  47.97 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  45.81 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  46.45 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  47.3 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  47.3 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  47.3 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  47.02 
 
 		 162 aa  140  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  47.18 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  45.95 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  44.76 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  42.11 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  45.07 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  42.45 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  42.45 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  45.32 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  38.3 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  40.14 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  40.43 
 
 		 162 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  39.01 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  39.86 
 
 		 188 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  35.33 
 
 		 169 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  31.21 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  30.57 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  28.77 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  30.72 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  29.14 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  24.68 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  30.71 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  26.92 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  28.36 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  27.07 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  35.46 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  32.45 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  29.2 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  26.8 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  28.67 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  24 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  25.79 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  29.55 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  26.72 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  26.45 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  26.15 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  29.85 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 232 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 126 aa  48.5  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  26.03 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  27.89 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  27.89 
 
 		 168 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  24.11 
 
 		 233 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  25.66 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>