281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3906 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 137 aa  273  6e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  48.8 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  48.41 
 
 		 139 aa  116  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  40.62 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  34.31 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  35.04 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  33.58 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  34.93 
 
 		 167 aa  72  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  32.26 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  28.1 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  38.38 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  36.76 
 
 		 182 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  29.86 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  34.11 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  38.6 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  31.09 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  34.81 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  31.82 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  35.65 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  28.79 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  29.85 
 
 		 209 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  28.91 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  28.46 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  28.46 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  41.18 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  36.19 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  32.58 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  26.52 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  37.84 
 
 		 156 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  25.56 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  25.76 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  27.48 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  26.52 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  25.56 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  26.15 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  40.23 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  32.2 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  25.37 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 232 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  32.58 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  27.46 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  31.06 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  37.35 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  31.85 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  31.97 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  50.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  35.06 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  35.06 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  28.3 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  28.93 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  33.68 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  31.46 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  35.06 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  18.18 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  29.91 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  23.08 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  28.1 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1977  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  28.46 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  31.48 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  31.48 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>