141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0879 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  314  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  50.35 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  45.99 
 
 
159 aa  124  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  42.25 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  42.96 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  42.86 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  45.99 
 
 
329 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 
158 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  38.76 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  41.35 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  42.96 
 
 
169 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  42.31 
 
 
156 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  42.96 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 
167 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  40.69 
 
 
335 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  39.31 
 
 
334 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  42.22 
 
 
175 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  40.69 
 
 
175 aa  103  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 
233 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  42.22 
 
 
175 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  42.22 
 
 
175 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 
168 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 
175 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 
175 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  41.48 
 
 
165 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 
175 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 
175 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  41.48 
 
 
332 aa  101  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  45 
 
 
301 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  38.06 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
158 aa  98.6  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  38.93 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  37.21 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  38.17 
 
 
163 aa  97.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  41.67 
 
 
295 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  40.83 
 
 
319 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  40.83 
 
 
304 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  40.54 
 
 
162 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  39.09 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  33.06 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  33.08 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  38.24 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  31.69 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  40.22 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  30.71 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  30.71 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  30.71 
 
 
154 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  30.71 
 
 
154 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  30.71 
 
 
154 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  31.13 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  34.78 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  34.21 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  32.46 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  29.77 
 
 
154 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  29.17 
 
 
188 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  28.06 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  34.71 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  27.54 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  27.88 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  28.1 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 
142 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  28.7 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 
154 aa  47.4  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  27.73 
 
 
166 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  27.78 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  35.44 
 
 
128 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  35.44 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  28.28 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  27.91 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  32.61 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  25.21 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  32.04 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  26.4 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  33.78 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  27.66 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  27.66 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  27.66 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  26.05 
 
 
162 aa  44.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  31.2 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  27.03 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>