221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0191 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  317  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  74.36 
 
 
156 aa  245  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  74.36 
 
 
156 aa  245  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  74.36 
 
 
156 aa  245  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  68.87 
 
 
161 aa  221  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  68.21 
 
 
155 aa  220  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  68.21 
 
 
155 aa  220  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  68.21 
 
 
155 aa  220  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  68.21 
 
 
155 aa  220  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  68.21 
 
 
155 aa  220  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  68.21 
 
 
155 aa  220  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  68.21 
 
 
161 aa  219  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  68.21 
 
 
161 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  68.87 
 
 
155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  69.23 
 
 
155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  68.87 
 
 
155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  68.87 
 
 
155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  68.87 
 
 
155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  68.87 
 
 
155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  66.03 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  63.4 
 
 
162 aa  204  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  64.9 
 
 
162 aa  204  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  58.33 
 
 
156 aa  180  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  51.61 
 
 
154 aa  158  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  48.7 
 
 
154 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  48.7 
 
 
154 aa  158  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  49.36 
 
 
154 aa  157  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  48.37 
 
 
154 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  49.35 
 
 
154 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  49.35 
 
 
154 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  49.35 
 
 
154 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  47.71 
 
 
154 aa  156  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  51.61 
 
 
154 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  48.05 
 
 
154 aa  154  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  50.32 
 
 
154 aa  152  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  51.02 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  45.45 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  46.36 
 
 
157 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  45.45 
 
 
155 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  51.45 
 
 
157 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  47.13 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  38.51 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  43.66 
 
 
166 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  36.69 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  39.57 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  39.57 
 
 
160 aa  97.1  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  40.58 
 
 
169 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  41.13 
 
 
188 aa  92  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  39.01 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  36.69 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  37.32 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  31.47 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  37.32 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  28.39 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  33.83 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  36.09 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  32.85 
 
 
158 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  28.78 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  31.51 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  30.14 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  28.24 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  35 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.53 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  26.95 
 
 
233 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  26.87 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  27.7 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  28.47 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 
319 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  27.78 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  28.99 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
304 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  32.5 
 
 
329 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  31.71 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  31.06 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  31.06 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  33.56 
 
 
167 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  29.23 
 
 
295 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  31.33 
 
 
167 aa  53.9  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  28.45 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  29.85 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  33.78 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  30.6 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  24.67 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  30.6 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  34.71 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 
144 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
141 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
127 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  28.79 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
127 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>