198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1251 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 136 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  94.12 
 
 		 136 aa  261  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  70.68 
 
 		 142 aa  203  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  59.85 
 
 		 145 aa  173  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  38.06 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  36.92 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  34.23 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  32.91 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  32.91 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  31.21 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  32.91 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  33.09 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  33.09 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  32.87 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  33.09 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  33.09 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  31.65 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  32.37 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  32 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  33.09 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  31.21 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  29.75 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  31.82 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  30.38 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  29.87 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.06 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  34.51 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  27.94 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  22.95 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  28.48 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  34.15 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  30.71 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  31.29 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  28.36 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  28.36 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  28.37 
 
 		 163 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  28.67 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  30.6 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  28.57 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  28.17 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 166 aa  50.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  26.05 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  26.05 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  28.89 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  26.05 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  28.89 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  28.89 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  28.89 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  28.89 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  34.52 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  29.17 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  29.17 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  32.94 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  29.17 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  27.73 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  27.73 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  27.73 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  27.73 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  29.41 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  27.14 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  31.76 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1959  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  27.14 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  26.11 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  25.98 
 
 		 334 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  34.02 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>