More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0295 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  316  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  75.32 
 
 		 157 aa  228  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  73.15 
 
 		 157 aa  221  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  48.28 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  47.1 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  48.55 
 
 		 155 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  48.55 
 
 		 155 aa  147  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  48.55 
 
 		 155 aa  147  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  48.55 
 
 		 161 aa  146  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  48.55 
 
 		 155 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  48.55 
 
 		 155 aa  147  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  47.1 
 
 		 154 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  48.55 
 
 		 155 aa  147  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  48.55 
 
 		 161 aa  146  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  47.1 
 
 		 154 aa  146  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  47.1 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  47.1 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  47.1 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  47.83 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  46.45 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  48.28 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  47.1 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  45.81 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  46.9 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  47.59 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  47.1 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  47.1 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  47.1 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  47.1 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  47.1 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  47.1 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  45.16 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  43.87 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  45.45 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  44.59 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  42.65 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  43.87 
 
 		 156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  42.11 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  42.75 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  43.42 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  41.45 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  41.45 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  41.45 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  42.75 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  40.79 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  43.8 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  44.12 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  43.57 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  38.61 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  35.46 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  38.69 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  35.77 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  32.9 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  36.11 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  38.06 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  33.58 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  32.85 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  36 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  33.9 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  31.17 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 304 aa  67.4  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  30.82 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  30.3 
 
 		 319 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.59 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  27.15 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  32.85 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  29.87 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  31.3 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  28.21 
 
 		 301 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  29.55 
 
 		 295 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  32.89 
 
 		 329 aa  60.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  34.78 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  29.49 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  29.49 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  29.49 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  37.21 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  29.37 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  31.86 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1582  phenylacetic acid degradation-like protein  34.88 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000511967  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  31.86 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  31.86 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  31.13 
 
 		 334 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  25.71 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  32.08 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>