136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0435 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  332  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  58.86 
 
 		 162 aa  200  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  47.92 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  47.92 
 
 		 160 aa  140  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  45.83 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  46.48 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  44.44 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  42.24 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  39.63 
 
 		 169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  40.13 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  40.82 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  38.16 
 
 		 154 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  38.51 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  38.51 
 
 		 154 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  38.51 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  38.51 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  37.5 
 
 		 155 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  40.56 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  40.14 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  40.58 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  40.58 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  40.58 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  38.13 
 
 		 157 aa  104  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  39.86 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  38.16 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  35.53 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  35.14 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  36.69 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  33.81 
 
 		 155 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  33.81 
 
 		 155 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  33.81 
 
 		 155 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  33.81 
 
 		 155 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  33.81 
 
 		 155 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  33.09 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  33.09 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  33.09 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  33.09 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  33.09 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  33.09 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  33.09 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  33.09 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  33.09 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  34.97 
 
 		 162 aa  94.4  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  32.48 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  36.69 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  33.81 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  33.81 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  33.81 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  32.61 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  33.82 
 
 		 136 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  31.06 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  25 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  31.96 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  27.81 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  32.03 
 
 		 329 aa  50.8  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  29.37 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  23.72 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 126 aa  48.1  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  27.5 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  25.2 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.87 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  25.38 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  29.58 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  30.43 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.9 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  28.28 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  28.12 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3799  thioesterase superfamily protein  28.06 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.254263  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  30.1 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  29.09 
 
 		 335 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  34.78 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  29.2 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  28.28 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  27.59 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  27.45 
 
 		 233 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  25.32 
 
 		 319 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  27.13 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  27.13 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  24.11 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  24.64 
 
 		 191 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>