161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1655 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  698    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  79.65 
 
 
334 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  78.57 
 
 
332 aa  557  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  76.72 
 
 
329 aa  531  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  93.06 
 
 
175 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  92.49 
 
 
175 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  92.49 
 
 
175 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  91.33 
 
 
175 aa  331  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  88 
 
 
175 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  88 
 
 
175 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  88 
 
 
175 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  88 
 
 
175 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  94.44 
 
 
165 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  94.44 
 
 
165 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  97.4 
 
 
165 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  94.44 
 
 
165 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  86.5 
 
 
165 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  92.11 
 
 
154 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  92.11 
 
 
154 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  92.11 
 
 
154 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  93.29 
 
 
159 aa  294  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  78.7 
 
 
180 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  81.48 
 
 
169 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  81.6 
 
 
168 aa  279  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  81.88 
 
 
154 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  77.3 
 
 
168 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  79.59 
 
 
147 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  81.12 
 
 
155 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  59.42 
 
 
144 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  55.17 
 
 
148 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  55.17 
 
 
148 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  56.94 
 
 
160 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 
148 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 
160 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  54.86 
 
 
160 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  54.86 
 
 
160 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 
150 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  35.18 
 
 
301 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  34.97 
 
 
304 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  32.29 
 
 
295 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  32.72 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  50.65 
 
 
157 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  53.57 
 
 
157 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  52.03 
 
 
156 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  51.8 
 
 
159 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  44.59 
 
 
178 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
158 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  43.06 
 
 
158 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  43.06 
 
 
158 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  43.06 
 
 
158 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 
139 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  51.2 
 
 
150 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 
144 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  41.5 
 
 
167 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  42.48 
 
 
173 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  46.62 
 
 
167 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  43.54 
 
 
233 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 
168 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  40.43 
 
 
168 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  40.43 
 
 
168 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
145 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  40.14 
 
 
172 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 
152 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  45.45 
 
 
152 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  40.3 
 
 
140 aa  119  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 
167 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  39.39 
 
 
163 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  38.64 
 
 
163 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  36.43 
 
 
163 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  34.29 
 
 
163 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  39.84 
 
 
141 aa  106  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
158 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  38.35 
 
 
167 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  40.69 
 
 
155 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 
151 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 
144 aa  99.8  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  37.5 
 
 
162 aa  98.2  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  37.1 
 
 
167 aa  93.6  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 
128 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  35.77 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
162 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  31.85 
 
 
168 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  31.85 
 
 
161 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  28.68 
 
 
157 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  38.37 
 
 
150 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  32.09 
 
 
166 aa  59.3  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  36.78 
 
 
155 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  30.19 
 
 
155 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
138 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  35.63 
 
 
154 aa  56.2  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  26.87 
 
 
157 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  31.2 
 
 
169 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  27.27 
 
 
138 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  30.39 
 
 
139 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  29.1 
 
 
163 aa  53.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
128 aa  52.8  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  29.5 
 
 
156 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  29.5 
 
 
156 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>