137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_43890 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  324  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  94.9 
 
 
157 aa  312  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  78.62 
 
 
159 aa  265  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  77.14 
 
 
178 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  67.12 
 
 
158 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  67.12 
 
 
158 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  66.44 
 
 
158 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  66.44 
 
 
158 aa  213  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  57.14 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  52.56 
 
 
175 aa  167  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  52.56 
 
 
175 aa  167  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  52.56 
 
 
175 aa  167  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  52.56 
 
 
175 aa  167  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  52.9 
 
 
180 aa  166  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  52.6 
 
 
165 aa  167  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  51.92 
 
 
175 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  51.92 
 
 
175 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  51.92 
 
 
175 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  51.92 
 
 
175 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  52.26 
 
 
156 aa  163  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  50.65 
 
 
335 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  53.38 
 
 
329 aa  161  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  50.64 
 
 
334 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  49.35 
 
 
332 aa  157  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  50.99 
 
 
168 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  49.58 
 
 
233 aa  127  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  43.36 
 
 
152 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  42.86 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 
167 aa  110  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  40.71 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  36.69 
 
 
167 aa  107  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  38.58 
 
 
163 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 
158 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  38.24 
 
 
140 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  37.8 
 
 
163 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  37.4 
 
 
319 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  36.13 
 
 
295 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  36.76 
 
 
301 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
167 aa  91.3  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 
304 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  34.45 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 
150 aa  58.2  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
173 aa  53.9  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  24.64 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  31.19 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  34.04 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  31.94 
 
 
139 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  29.79 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  28 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  26.81 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  27.97 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
165 aa  47.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
160 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  33.33 
 
 
138 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
160 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  25.66 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  30.61 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  27.59 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  32.26 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  21.48 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  23.26 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  22.48 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  21.48 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  27.03 
 
 
188 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  30.21 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  27.45 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  29.59 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  24.83 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  27.45 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
144 aa  44.3  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  25.74 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
155 aa  44.3  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  26.32 
 
 
172 aa  43.9  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  32 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  29.17 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  23.85 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>