182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0383 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  313  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  313  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  313  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  98.05 
 
 
154 aa  310  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  96.1 
 
 
154 aa  303  6e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  96.1 
 
 
154 aa  303  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  94.81 
 
 
154 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  95.45 
 
 
154 aa  300  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  94.16 
 
 
154 aa  300  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  87.66 
 
 
154 aa  285  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  85.06 
 
 
154 aa  278  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  85.06 
 
 
154 aa  274  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  82.47 
 
 
154 aa  269  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  83.12 
 
 
154 aa  268  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  81.17 
 
 
154 aa  266  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  49.35 
 
 
156 aa  157  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  49.68 
 
 
155 aa  157  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  48.39 
 
 
155 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  48.39 
 
 
155 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  48.39 
 
 
155 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  48.39 
 
 
155 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  48.39 
 
 
155 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  47.1 
 
 
155 aa  153  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 
155 aa  153  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  47.1 
 
 
155 aa  153  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  47.1 
 
 
155 aa  153  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  47.1 
 
 
155 aa  153  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  47.1 
 
 
155 aa  153  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  47.1 
 
 
161 aa  153  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  47.1 
 
 
161 aa  153  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  46.45 
 
 
161 aa  152  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  47.1 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  46.41 
 
 
156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  46.41 
 
 
156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  46.41 
 
 
156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  43.87 
 
 
156 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  49.3 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  46.48 
 
 
162 aa  134  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  46.05 
 
 
157 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  45.07 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  46.85 
 
 
157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  44.37 
 
 
156 aa  124  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  40.58 
 
 
160 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  40.58 
 
 
160 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  36.69 
 
 
162 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  40.58 
 
 
163 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  40.91 
 
 
166 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  38.93 
 
 
188 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  39.72 
 
 
162 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  36.84 
 
 
163 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  34.67 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  32.26 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  33.09 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  27.4 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  30.99 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  30.71 
 
 
155 aa  60.5  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  30.53 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  27.07 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  27.69 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  23.42 
 
 
167 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  30.97 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  26.09 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  29.58 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  28.06 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.01 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
166 aa  51.2  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  24.34 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  26.14 
 
 
158 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  29.1 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  23.13 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  25.5 
 
 
301 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  28.79 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  23.68 
 
 
233 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  32.87 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1582  phenylacetic acid degradation-like protein  31.09 
 
 
146 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000511967  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  27.98 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  24 
 
 
191 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  27.98 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  32.87 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  24.04 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>