279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0947 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  59.12 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  57.55 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  34.15 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  31.11 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  39.25 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  32.41 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  37.84 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 233 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  29.69 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  33.73 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  30.32 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  29.32 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  32.53 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  36.52 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  38.2 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  31.58 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  35.87 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  29.75 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  36.78 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  30.12 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  34.31 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  35.63 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  35.63 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  35.63 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  35.63 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  34.52 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  36.78 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  36.78 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  35.63 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  36.78 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  36.78 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  35.35 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  34.04 
 
 		 329 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.35 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  33.04 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  25.18 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.47 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  33.04 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.96 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 332 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.56 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  32.03 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  42.17 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  31.34 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  38.36 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  25.41 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  42.17 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  33.67 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  25.9 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  39.47 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  29.29 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  30.23 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  29.81 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  29.92 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  33.7 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  29 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.21 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  26.89 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  31.87 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  29.46 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  25.76 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  28.93 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  34.21 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  25.17 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.21 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  24.24 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  31.11 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 		 319 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.21 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 304 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>