115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1733 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 154 aa  322  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  82.67 
 
 		 334 aa  271  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  88.11 
 
 		 168 aa  271  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  81.82 
 
 		 154 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  81.82 
 
 		 154 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  81.82 
 
 		 154 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  81.7 
 
 		 159 aa  270  7e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  81.88 
 
 		 335 aa  267  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  85.31 
 
 		 332 aa  266  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  85.31 
 
 		 165 aa  266  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  85.31 
 
 		 165 aa  266  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  85.31 
 
 		 165 aa  266  8e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  85.31 
 
 		 165 aa  266  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  78.38 
 
 		 155 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  81.82 
 
 		 147 aa  256  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  77.7 
 
 		 329 aa  254  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  58.27 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  56.34 
 
 		 148 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  57.04 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  55.24 
 
 		 148 aa  181  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 160 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 160 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  54.23 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  49.19 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  51.24 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 144 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  43.66 
 
 		 173 aa  126  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  40.82 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  37.43 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  37.43 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  38.73 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  36.3 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  40.65 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  34.25 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  40.31 
 
 		 301 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 		 304 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  36.07 
 
 		 295 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  35.04 
 
 		 319 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  33.87 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  31.97 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  26.85 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  26.79 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  27.82 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 233 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  26.98 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  29 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  26.4 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  26.47 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  26.47 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  26.47 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  26.47 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  26.4 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  26.19 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  22.83 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  26.88 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  25.41 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  27.45 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  24.39 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  18.32 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  25 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  25 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  26.77 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  25 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  25 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  25 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  25 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  25 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  25 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  25.56 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  25.37 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  27.66 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  27.13 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  24.8 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  26.77 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  29.47 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  26.15 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  26.15 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  24.81 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  26.15 
 
 		 154 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  26.92 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  27.43 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  23.88 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>