258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0843 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 144 aa  290  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  72.06 
 
 		 140 aa  201  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  76.69 
 
 		 163 aa  201  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  75.94 
 
 		 163 aa  200  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  71.88 
 
 		 151 aa  191  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  64.63 
 
 		 167 aa  189  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  48.85 
 
 		 167 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  49.59 
 
 		 319 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  49.17 
 
 		 295 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  41.35 
 
 		 334 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  47.5 
 
 		 304 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 		 233 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  40.6 
 
 		 332 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  43.85 
 
 		 301 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  37.14 
 
 		 329 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  37.59 
 
 		 335 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  36.84 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  36.62 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  37.98 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  38.4 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  36.09 
 
 		 180 aa  98.2  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  37.98 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  38.13 
 
 		 155 aa  96.7  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  37.8 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 175 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 175 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 175 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 175 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  38.28 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 158 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 162 aa  93.6  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  39.83 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  35.43 
 
 		 178 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  35.43 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  41.79 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  46.07 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  32.9 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  31.97 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  32.89 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  32.33 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  35.16 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  28.48 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  36.19 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  33.59 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  34.62 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  28.21 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  27.44 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  26.92 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  26.92 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  26.92 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  26.92 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  26.92 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  27.97 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  26.92 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  26.92 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  26.92 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  26.28 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  34.9 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  26.28 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  26.28 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  26.28 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  26.28 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.58 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2124  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  28.4 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  35.29 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  27.21 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  27.27 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  32.11 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  27.27 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  27.27 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.77 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  27.7 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  27.07 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  27.69 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  32.56 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>