220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1378 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  305  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  52.34 
 
 
167 aa  144  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  50.35 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  46.56 
 
 
319 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  44.36 
 
 
157 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  43.36 
 
 
157 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 
159 aa  120  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  48.03 
 
 
169 aa  120  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  45.67 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  45.45 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  45.67 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  44.88 
 
 
175 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
158 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  44.88 
 
 
175 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  44.88 
 
 
175 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  44.88 
 
 
175 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  45.67 
 
 
175 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  45.67 
 
 
175 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  45.67 
 
 
175 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  47.93 
 
 
329 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
158 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  45.67 
 
 
180 aa  117  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  45.16 
 
 
295 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  44 
 
 
233 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 
304 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  38.69 
 
 
178 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  43.09 
 
 
301 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  38.06 
 
 
168 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  40.16 
 
 
140 aa  110  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  43.8 
 
 
334 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  40.94 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  40.16 
 
 
163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  42.4 
 
 
162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  41.32 
 
 
332 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  40.3 
 
 
167 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  43.59 
 
 
156 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  38.89 
 
 
151 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  35.54 
 
 
167 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
158 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 
162 aa  90.1  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 
150 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  39.26 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  34.65 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  34.4 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  32.8 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  36 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  32.77 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  36.43 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  32 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  39.25 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  28.45 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  31.93 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  35.2 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  36.61 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  35.2 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  35.2 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  30.25 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  31.2 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  38.38 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  36.61 
 
 
248 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  36.61 
 
 
374 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  37.61 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  35.71 
 
 
238 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  37.27 
 
 
169 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  33.08 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  33.63 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  33.63 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  35 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  35.16 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  32.79 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  31.01 
 
 
162 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  32.26 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  32.26 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  32.26 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 
155 aa  57.4  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  35.71 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  30.22 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  29.86 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>