93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1377 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
152 aa  310  4.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  46.26 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 
168 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  45.52 
 
 
148 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  46.1 
 
 
160 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  45.33 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  45.77 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  42.03 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  44.06 
 
 
329 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  42.03 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  42.03 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  42.47 
 
 
155 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  42.03 
 
 
165 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  42.03 
 
 
165 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  42.03 
 
 
165 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  42.03 
 
 
165 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  45.07 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  45.07 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 
332 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  42.03 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  40.69 
 
 
334 aa  123  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 
147 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  41.3 
 
 
335 aa  121  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 
154 aa  120  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  53.66 
 
 
150 aa  120  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 
144 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  42.47 
 
 
150 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  45 
 
 
145 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  39.57 
 
 
144 aa  116  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  46.46 
 
 
139 aa  114  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  37.18 
 
 
168 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  36.54 
 
 
168 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  36.54 
 
 
168 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  41.98 
 
 
295 aa  97.1  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  40.5 
 
 
301 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  42.28 
 
 
319 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  42.06 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  35.29 
 
 
163 aa  94  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  41.46 
 
 
304 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  37.58 
 
 
167 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  35.77 
 
 
163 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  33.54 
 
 
172 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 
167 aa  90.1  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  41.67 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  31.94 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  30.88 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  25.78 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  29.92 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
138 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  27.74 
 
 
175 aa  60.5  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  27.74 
 
 
175 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  27.74 
 
 
175 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  27.74 
 
 
175 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  26.72 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  30 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  25 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  25 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  30.58 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  28.03 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  28.03 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
233 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
158 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
168 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 
175 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 
175 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 
175 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 
175 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  24.8 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  28.68 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  29.73 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  29.7 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  28.37 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  28.57 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  28.23 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  31.34 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  27.21 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  30 
 
 
139 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  26.87 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  30.37 
 
 
157 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  25.52 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  27.93 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>