270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_69270 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  91.72 
 
 
157 aa  292  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  73.15 
 
 
155 aa  221  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  46.05 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  48.55 
 
 
161 aa  134  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  46.05 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  46.05 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  46.05 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  47.83 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  47.83 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  47.83 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  47.83 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  47.83 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  47.83 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  47.83 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  47.83 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  45.75 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  43.79 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  46.15 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  43.79 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  43.79 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  47.83 
 
 
155 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  47.83 
 
 
155 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  47.83 
 
 
155 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  47.83 
 
 
155 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  47.83 
 
 
155 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  45.75 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  44.44 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  45.27 
 
 
162 aa  130  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  47.89 
 
 
154 aa  130  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  46.94 
 
 
154 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  46.94 
 
 
154 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  45.64 
 
 
155 aa  130  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  43.21 
 
 
162 aa  130  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  46.94 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  45.77 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  51.45 
 
 
156 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  47.18 
 
 
154 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  42.11 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  44.9 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  42.28 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  44.97 
 
 
156 aa  124  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  43.31 
 
 
163 aa  120  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  42.65 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  45.14 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  43.95 
 
 
166 aa  110  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  41.82 
 
 
188 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  43.87 
 
 
162 aa  107  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  41.61 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  41.61 
 
 
160 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  37.5 
 
 
163 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  34.29 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  32.14 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  30.67 
 
 
233 aa  73.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  34.19 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  32.89 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  34.4 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  30 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  33.33 
 
 
329 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  31.91 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  38.24 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  35.57 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  31.21 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  35.11 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  31.01 
 
 
180 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  34.06 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  29.46 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  31.03 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  28.68 
 
 
335 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  31.03 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  27.91 
 
 
175 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.59 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  33 
 
 
332 aa  61.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  27.91 
 
 
175 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  27.91 
 
 
175 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  32.81 
 
 
141 aa  60.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  27.91 
 
 
175 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  31.85 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  28.68 
 
 
334 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  31.06 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  28.48 
 
 
301 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
175 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
175 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  27.81 
 
 
144 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
175 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>