146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5263 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 158 aa  326  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  47.2 
 
 		 233 aa  121  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  46.38 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  50 
 
 		 295 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  43.36 
 
 		 319 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  47.11 
 
 		 332 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  41.91 
 
 		 175 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  40.65 
 
 		 301 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  41.91 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  41.18 
 
 		 335 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  41.91 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  41.91 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  41.22 
 
 		 329 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  45.45 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  37.76 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  49.54 
 
 		 304 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  39.22 
 
 		 180 aa  103  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  42.15 
 
 		 334 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  36.88 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  36.17 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  41.84 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  37.59 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 		 167 aa  99.8  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  35.81 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  48.11 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  37.23 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  39.42 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  37.23 
 
 		 163 aa  97.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  36.23 
 
 		 140 aa  97.1  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  43.81 
 
 		 158 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  37.96 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  44.07 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 158 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  37.19 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 		 144 aa  89  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  32.64 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  38.64 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  29.86 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  30.94 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  30.46 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  30.46 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  30.46 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  31.54 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  31.51 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  29.25 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  27.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  37.18 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  31.82 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  26.8 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  34.38 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  35.42 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  30.82 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  31.52 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  29.36 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  24.2 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  26.14 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  26.8 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  28.1 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  26 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  26.14 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  28.26 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  28.15 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  27.14 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  27.14 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  27.14 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  27.14 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  26 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  27.14 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  27.14 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  27.14 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  27.14 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  27.14 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  24.84 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  27.86 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  36.84 
 
 		 209 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  27.86 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  27.86 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  26.14 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  25.79 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  26.14 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  27.86 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  26.14 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  27.86 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  27.74 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  24.65 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  30.19 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  28.83 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>