210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1049 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  57.55 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  56.83 
 
 		 139 aa  163  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  48.12 
 
 		 150 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  44.03 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  43.18 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  39.77 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  28.86 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  33.9 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  36.19 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  38.55 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  35.57 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  33.63 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  32.88 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  35.94 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  28.86 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  28.86 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  32.61 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  37.35 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  28.78 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  28.78 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  30.08 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  34.94 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  30.08 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  31.15 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  31.15 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  30.08 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  30.08 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  29.03 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  33.73 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  31.15 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  31.62 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  31.62 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  31.62 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  31.62 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  31.62 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  29.53 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  31.03 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  30.97 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  30.97 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  30.97 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  30.97 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  30.97 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  29.27 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 233 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  29.2 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  31.03 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  31.03 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  31.03 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  31.03 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  31.03 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  31.03 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  31.03 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  26.67 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  31.03 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  28.32 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  27.15 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  28.68 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  34.38 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  27.52 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  34.21 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  30.25 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  31.3 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  30.91 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  26.83 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  34.25 
 
 		 295 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  28.45 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  34.38 
 
 		 329 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  29.27 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  32.88 
 
 		 304 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  32.29 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  36.36 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  28.46 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  33.91 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  32.88 
 
 		 319 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  32.29 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  34.04 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 175 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 175 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>