More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5821 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  75.94 
 
 		 144 aa  209  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  51.52 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  48.41 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  38.17 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  37.4 
 
 		 136 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  35.34 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  32.31 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  34.35 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  33.59 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  29.49 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  32.06 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  67  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  32.06 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  32.8 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  30.53 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  34.45 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  30.53 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  29.03 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  28.39 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 232 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  27.15 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  35.96 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  35.96 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  31.93 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  38.6 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  31.5 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  29.1 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  26.52 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  29.63 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  36.26 
 
 		 122 aa  57  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  24.32 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  29.84 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  26.62 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  26.62 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  26.62 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  28.46 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  23.31 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  34.48 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  26.43 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  26.81 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  28.21 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  21.8 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  26.71 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  23.87 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  27.41 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  27.73 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  27.14 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  32.23 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  27.82 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 209 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  26.32 
 
 		 162 aa  52  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  25.16 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  30.61 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  23.48 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  31.19 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  26.35 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  25.36 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  25.36 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  25.36 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  28.19 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  25.36 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.24 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>