158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0912 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
138 aa  288  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  34.43 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.89 
 
 
148 aa  60.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  32 
 
 
165 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  32.8 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  30.83 
 
 
146 aa  59.3  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  31.15 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  29.06 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  27.82 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  31.15 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  27.82 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  29.84 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  26.83 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  26.83 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  30 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 
183 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  27.34 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  27.34 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  27.34 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  27.34 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  27.34 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  27.34 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  27.34 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  28.46 
 
 
161 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  27.12 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
179 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  26.83 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  25.6 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  30.77 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  27.69 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  27.59 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  29.17 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  29.23 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  33.04 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  26.15 
 
 
154 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  27.69 
 
 
154 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  26.92 
 
 
155 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  24.09 
 
 
161 aa  50.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  26.15 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  32.35 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  26.52 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  31.11 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  30.88 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  31.4 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  25.38 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  30.4 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0110  phenylacetic acid degradation-related protein  26.02 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  25.38 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  26.27 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  25.38 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  23.77 
 
 
161 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11565  hypothetical protein  32.17 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  31.37 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
181 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  28.32 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  31.18 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  26.15 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  34.74 
 
 
135 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  35.23 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  25.38 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  25.38 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  25.38 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  25.38 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  25.38 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  25 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  23.85 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  24.62 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  35.53 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  36.11 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  35.23 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  33.68 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  25.38 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.524334 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>