More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0186 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 142 aa  280  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  83.1 
 
 		 144 aa  233  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  70.68 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  46.67 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  43.18 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  44.19 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  43.59 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  37.59 
 
 		 143 aa  91.7  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  41.88 
 
 		 160 aa  90.5  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  42.74 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  42.74 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  41.88 
 
 		 160 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  41.88 
 
 		 160 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  41.88 
 
 		 160 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  41.88 
 
 		 160 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  41.88 
 
 		 160 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  41.88 
 
 		 160 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  41.88 
 
 		 160 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  41.03 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  42.74 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  44.19 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  36.72 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  38.41 
 
 		 176 aa  87.8  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 		 135 aa  87.4  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  37.82 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  38.58 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  45.69 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  40.83 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  38.33 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  36.92 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  38.52 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  36.03 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  38.02 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  43.1 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  38.26 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  36.75 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  33.33 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 		 165 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  31.03 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  33.62 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  30.88 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  31.62 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  31.43 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  36.59 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  30.07 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  30.88 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  30.88 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  30.88 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  30.88 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  30.88 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  30.88 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  30.88 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  40.86 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  34.65 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  34.19 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  30.15 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  32.52 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  30.88 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  35.04 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  35.04 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  29.37 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  34.96 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  36.27 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>