193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0167 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  100 
 
 		 144 aa  293  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  80.85 
 
 		 149 aa  235  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  59.06 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  56.69 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  39.71 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  40.74 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  40.65 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  42.62 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  38.97 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  40.65 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  37.8 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  35.54 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  41.8 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  40.77 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  35.54 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  40.83 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  34.71 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  34.71 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  34.71 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  34.71 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  34.71 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  34.71 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  34.71 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  34.75 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  35.34 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  34.85 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  37.3 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  34.81 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  32.62 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  34.92 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  32.52 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  34.19 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  37.36 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  28.7 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  31.36 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  34.91 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  33.98 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  24.58 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  29.06 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  30.61 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  29.92 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  30.17 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  30.25 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  31.63 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  26.09 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  29.41 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  30.53 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  29.31 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  28.33 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  27.56 
 
 		 133 aa  48.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  36.27 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>