230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0117 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
155 aa  310  6.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  98.06 
 
 
155 aa  305  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  75.69 
 
 
160 aa  226  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  40.41 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  38.97 
 
 
144 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 
144 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  36.03 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  34.68 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  40.57 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  31.3 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  35.29 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  38.6 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  35.35 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  34.31 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  37.72 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  31.68 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  34.95 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  32.35 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  32.35 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  32.35 
 
 
160 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  32.35 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  32.35 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  32.35 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  32.35 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  32.35 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.19 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  31.2 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  38.21 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  29.45 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  29.37 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  32.06 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  36.13 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  33.91 
 
 
209 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  38.2 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  38.2 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  37.19 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  37.19 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  26.9 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.46 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  29.03 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11565  hypothetical protein  29.5 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  36.63 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
232 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
139 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  43.62 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  32.26 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  37.63 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  37.63 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  31.78 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  32.39 
 
 
189 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  37.63 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  31 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  31.63 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  30.83 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  31.68 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
233 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  36.27 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
181 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  30.94 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  28.36 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  33.94 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 
154 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  34.34 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
161 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
183 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  30.48 
 
 
138 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>