245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1845 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  76.51 
 
 		 149 aa  235  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  63.76 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  61.9 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  65.94 
 
 		 137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  61.9 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  61.19 
 
 		 148 aa  166  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  64.29 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  64.29 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  57.78 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  53.54 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  52.27 
 
 		 176 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  51.22 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  47.62 
 
 		 161 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  45.24 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  47.24 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  47.24 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  43.36 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  43.36 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  45.24 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  45.24 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  45.24 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  45.24 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  45.24 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  45.24 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  45.24 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  42.66 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  46.46 
 
 		 160 aa  105  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  44.88 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  44.09 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  44.88 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  47.62 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  41.22 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  34.33 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  40.86 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  34.92 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.51 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  28 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  41.49 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  32.76 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  29.27 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  40.43 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  40.43 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  35.64 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  37.63 
 
 		 169 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  37.19 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2825  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249346  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  33.93 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  35.92 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.83 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  34 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  34.41 
 
 		 179 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  34.23 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  27.42 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  32.65 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 225 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  25.37 
 
 		 209 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  35.9 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  32.29 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  32.29 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>