159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3104 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  41.53 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  45.54 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  39.83 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  32.35 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32.35 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  32.76 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  43.18 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  33.61 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.05 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1683  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.083684  normal  0.174772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  35.34 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  38.02 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  39.17 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  33.33 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  35.56 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  33.33 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  32.8 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  33.98 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  33.9 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  30.65 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  33.98 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 181 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  35.48 
 
 		 319 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  34.38 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  31.68 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  36.96 
 
 		 295 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  36.26 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  34.38 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  34.62 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 304 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  32.2 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 225 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  32.17 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  32.52 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  32.52 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  32.52 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  32.52 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  32.52 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  32.52 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  32.52 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.1 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  31.62 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2042  hypothetical protein  32.35 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1780  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  31.25 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  31.11 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  35.23 
 
 		 169 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 193 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  39.51 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  35.56 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3386  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.220189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  36.26 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0284  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.719156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  32.69 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  42.59 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 184 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  34.96 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  32.69 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  32.69 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  32.69 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  32.69 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  32.58 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  34.96 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  32.97 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  32.69 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  31.71 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>