298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1850 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  100 
 
 		 154 aa  319  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  70.47 
 
 		 165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  60.87 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  58.7 
 
 		 144 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  58.7 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  56.8 
 
 		 161 aa  147  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  54.4 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  54.4 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  54.4 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  55.2 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  54.4 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  53.6 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  54.4 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  55.2 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  55.2 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  55.2 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  55.2 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  55.2 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  55.2 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  54.4 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  55.2 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  53.6 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  47.66 
 
 		 143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  46.85 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  52.5 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  45.8 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  52 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  46.97 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  48.51 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  46.83 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  48.8 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  51.22 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  45.31 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  48.36 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  43.2 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  44.19 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  39.83 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  39.37 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  41.75 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  35.43 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  44.32 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  39.34 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  32.23 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  32.62 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  37.25 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  35.29 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  32 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  30.23 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  28.93 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  29.46 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  28.24 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  32.28 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  31.67 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  38.82 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  30.63 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  32.76 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  39.78 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  27.59 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  28.99 
 
 		 209 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  31.4 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  28.35 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>