220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0959 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 169 aa  343  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  72.02 
 
 		 169 aa  261  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  52.55 
 
 		 139 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  50.69 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  46.3 
 
 		 193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  48.61 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  46.1 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  52.11 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  46.53 
 
 		 185 aa  141  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  48.61 
 
 		 179 aa  141  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  51.43 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  47.55 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  45.52 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  49.31 
 
 		 204 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  46.81 
 
 		 179 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  48.18 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  44.74 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  45.14 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  44.97 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  45 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  45 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  56.19 
 
 		 146 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  45.77 
 
 		 225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  41.94 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  42.14 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 		 148 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  42.07 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  42.36 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  35.46 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  43.75 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  43.06 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  38.73 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  35.57 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  40.85 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  46.04 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  41.01 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  34.75 
 
 		 142 aa  99.8  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  40.29 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 174 aa  97.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  38.41 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  36.96 
 
 		 145 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 		 191 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  36.23 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  34.31 
 
 		 146 aa  94.4  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  51.61 
 
 		 179 aa  94.4  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 145 aa  94  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  34.78 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  35.51 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  35.51 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  35.97 
 
 		 232 aa  91.7  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  39.86 
 
 		 145 aa  88.2  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  88.2  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  88.2  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  39.86 
 
 		 145 aa  88.2  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  39.86 
 
 		 145 aa  88.2  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  39.13 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  36.05 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  42 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  31.54 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  37.11 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0284  thioesterase superfamily protein  40.7 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.719156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  31.82 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  35.56 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  38.54 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  39.78 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  35.92 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  34.26 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  39.36 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  35.63 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  34.38 
 
 		 127 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  31.67 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  33.62 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  38.95 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 		 127 aa  50.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  36.67 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>