124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0284 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0284  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 142 aa  297  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.719156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3386  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.220189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  40.7 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  36.25 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  30.95 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.67 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  31.67 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  34.52 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  27.97 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33.04 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  28.79 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.04 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  31.37 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  31.73 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  35.63 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  32.35 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 191 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  30.39 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  30.39 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  30.39 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  32.94 
 
 		 179 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2156  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 		 184 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  32.63 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  31.37 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  31.37 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  31.37 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  31.37 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  31.37 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  29.08 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  31.37 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 715 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  31.37 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  33 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  28.35 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  28 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  27.56 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  24.11 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  30.69 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  33.75 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  32.35 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  25.23 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  30.69 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  25.77 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  28.32 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  36.26 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  32.58 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2044  thioesterase superfamily protein  25.96 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  25.81 
 
 		 319 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  28.41 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 304 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  24.04 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  27.72 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  27.2 
 
 		 187 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  30.3 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  24.73 
 
 		 295 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.65 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  33.77 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  27.43 
 
 		 136 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  31.76 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  33.77 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  33.67 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  31.33 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  30.34 
 
 		 160 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>