165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2924 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  70.9 
 
 		 139 aa  207  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  60.34 
 
 		 204 aa  208  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  57.99 
 
 		 187 aa  207  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  56.57 
 
 		 182 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  53.23 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  54.6 
 
 		 182 aa  194  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  54.86 
 
 		 182 aa  187  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  51.15 
 
 		 193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  54.22 
 
 		 179 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 		 189 aa  168  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  52.41 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  46.05 
 
 		 158 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  42.04 
 
 		 169 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  44.74 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  46.62 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  48.18 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  47.45 
 
 		 145 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  47.45 
 
 		 145 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  46.72 
 
 		 145 aa  124  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  48.18 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  47.45 
 
 		 145 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  47.45 
 
 		 145 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  44.59 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  41.29 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  39.62 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  44.83 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  46.72 
 
 		 145 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  44.52 
 
 		 146 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  41.13 
 
 		 142 aa  118  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  44.76 
 
 		 144 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  44.06 
 
 		 144 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  40.56 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  39.1 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  39.47 
 
 		 156 aa  111  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  37.93 
 
 		 146 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  40.69 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  40.69 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  40.69 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  44.85 
 
 		 148 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  40.69 
 
 		 144 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  46.72 
 
 		 145 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  46.72 
 
 		 145 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  46.72 
 
 		 145 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  46.72 
 
 		 145 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  46.72 
 
 		 145 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  47.46 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  45.99 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  36.71 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  37.59 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  37.96 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  37.25 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  37.25 
 
 		 158 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 		 174 aa  91.3  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  35.25 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  35.25 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  44.66 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  32.87 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  31.74 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  40.22 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.85 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  36.67 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  32.84 
 
 		 137 aa  62  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  35.25 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  31.29 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  30.63 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 135 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  33.81 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  30.63 
 
 		 135 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  34.69 
 
 		 161 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3386  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.220189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 148 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  28.97 
 
 		 161 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 134 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  31.91 
 
 		 155 aa  48.9  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  27.19 
 
 		 161 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 135 aa  48.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 140 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  29.03 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  28.1 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  31.63 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  31.37 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>