212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1893 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  67.69 
 
 		 191 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  57.23 
 
 		 174 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  50.3 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  50.3 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  49.09 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  48.75 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  46.25 
 
 		 176 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  44.85 
 
 		 184 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 		 191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  38.62 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  46.25 
 
 		 170 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  44.38 
 
 		 181 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  40.24 
 
 		 165 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  43.42 
 
 		 167 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  41.45 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 		 159 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  45.77 
 
 		 169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  42.65 
 
 		 139 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 		 144 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  42.25 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 144 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 144 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 144 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  40.69 
 
 		 145 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 		 146 aa  108  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  41.84 
 
 		 158 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  37.84 
 
 		 179 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  39.44 
 
 		 179 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  36.88 
 
 		 165 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  43.26 
 
 		 156 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  40.71 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  40.85 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  42.14 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  37.06 
 
 		 146 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 		 145 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  42.66 
 
 		 155 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  38.62 
 
 		 145 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 145 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  41.43 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  39.31 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  41.13 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  39.29 
 
 		 193 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  39.31 
 
 		 145 aa  102  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 164 aa  101  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  40.13 
 
 		 158 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  40.13 
 
 		 158 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 		 182 aa  98.2  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  34.29 
 
 		 145 aa  98.2  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  38.57 
 
 		 182 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  34.27 
 
 		 147 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  35.71 
 
 		 161 aa  96.3  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  40 
 
 		 145 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  40 
 
 		 145 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  40 
 
 		 145 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  40 
 
 		 145 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  39.31 
 
 		 145 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  34.27 
 
 		 144 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  34.27 
 
 		 144 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  34.75 
 
 		 153 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  41.96 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  36.9 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  34.56 
 
 		 148 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 		 161 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  31.25 
 
 		 140 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 151 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  29.6 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  29.6 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 138 aa  62  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  26.09 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 138 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  36.13 
 
 		 138 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1683  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.083684  normal  0.174772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  37.08 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  30.08 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  30.25 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  29.23 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 		 149 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 144 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 144 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  35.23 
 
 		 126 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 		 159 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.58 
 
 		 147 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2042  hypothetical protein  32.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 136 aa  52.8  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 161 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  29.27 
 
 		 159 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>