201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0688 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  298  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  56.94 
 
 
144 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  56.94 
 
 
144 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  58.45 
 
 
142 aa  177  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  56.25 
 
 
144 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  58.62 
 
 
145 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  56.25 
 
 
144 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  58.62 
 
 
145 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  58.62 
 
 
145 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  58.62 
 
 
145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  57.24 
 
 
145 aa  170  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  58.62 
 
 
165 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  57.93 
 
 
145 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  55.56 
 
 
145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  52.78 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  52.78 
 
 
144 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  48.97 
 
 
147 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  55.56 
 
 
145 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  55.56 
 
 
145 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  55.56 
 
 
145 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  55.56 
 
 
145 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  55.56 
 
 
145 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  54.86 
 
 
145 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  54.86 
 
 
145 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  47.14 
 
 
145 aa  140  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  43.57 
 
 
191 aa  118  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 
167 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  50.96 
 
 
182 aa  114  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  42.14 
 
 
184 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  41.35 
 
 
139 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  37.59 
 
 
155 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  37.93 
 
 
189 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
225 aa  107  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
183 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  39.72 
 
 
187 aa  105  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  41.73 
 
 
156 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
182 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 
160 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 
182 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  36.17 
 
 
179 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
159 aa  100  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  36.17 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  36.17 
 
 
158 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  34.75 
 
 
179 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 
189 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
169 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  36.88 
 
 
193 aa  97.4  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  36.23 
 
 
176 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  36.23 
 
 
176 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  35.46 
 
 
185 aa  96.7  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  37.59 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 
204 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  38.3 
 
 
182 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 
176 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  34.31 
 
 
169 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
181 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  38.69 
 
 
161 aa  86.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  35.21 
 
 
170 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  35.82 
 
 
209 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  32.58 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  29.63 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  34.78 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  31.4 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  31.4 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  29.91 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  33.59 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  36.27 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  31.36 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  31.36 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  31.36 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  31.36 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  31.36 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  31.36 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  31.36 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  31.39 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  31.36 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  30.4 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>