170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1025 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 
167 aa  342  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  62.03 
 
 
160 aa  201  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  57.14 
 
 
158 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  57.14 
 
 
158 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  63.51 
 
 
155 aa  189  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  43.48 
 
 
187 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  45.14 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  43.92 
 
 
185 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  50.38 
 
 
139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  46.31 
 
 
204 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  46.05 
 
 
182 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  44.59 
 
 
189 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  43.42 
 
 
225 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  42.57 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  43.57 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 
159 aa  117  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  45.07 
 
 
189 aa  117  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  43.54 
 
 
179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  42.76 
 
 
158 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  42.18 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  47.83 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 
176 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  41.06 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  36.88 
 
 
142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 
182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  48.92 
 
 
156 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 
144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
144 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
144 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  42.07 
 
 
169 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
144 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  41.5 
 
 
176 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  41.55 
 
 
174 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  41.5 
 
 
176 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  37.76 
 
 
147 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  39.29 
 
 
169 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 
181 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 
144 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  40.85 
 
 
145 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  40.56 
 
 
145 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 
144 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  35.51 
 
 
145 aa  100  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  40.14 
 
 
145 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  40.14 
 
 
145 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  41.01 
 
 
146 aa  99.8  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  39.44 
 
 
165 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  41.26 
 
 
145 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  41.26 
 
 
145 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  41.26 
 
 
145 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  41.26 
 
 
145 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  41.26 
 
 
145 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  36.49 
 
 
161 aa  97.4  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  37.32 
 
 
145 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  40.56 
 
 
145 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  40.56 
 
 
145 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  38.3 
 
 
209 aa  90.9  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  34.01 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 
170 aa  89  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  36.77 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  40.31 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  35.97 
 
 
232 aa  80.9  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  36.99 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.88 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  34.74 
 
 
182 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  32.56 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  25.69 
 
 
150 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  35.59 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  35.59 
 
 
199 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  32.23 
 
 
135 aa  54.3  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32.23 
 
 
135 aa  54.3  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  34.75 
 
 
139 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
148 aa  53.9  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  35.59 
 
 
139 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
213 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
159 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  25 
 
 
150 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  35.85 
 
 
147 aa  50.8  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  30.5 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  34.34 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  31.68 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  33.9 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  29.9 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  33.06 
 
 
139 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
148 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  34.48 
 
 
142 aa  48.5  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  35.87 
 
 
146 aa  48.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
139 aa  47.8  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
149 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 
154 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>