263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0944 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 170 aa  341  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  51.88 
 
 		 184 aa  169  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  47.55 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  45.83 
 
 		 182 aa  134  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  41.72 
 
 		 183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  46.25 
 
 		 225 aa  134  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  41.61 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  41.61 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  44.37 
 
 		 187 aa  130  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  45.32 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  43.98 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  43.71 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  40.38 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  43.75 
 
 		 191 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  42.77 
 
 		 232 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  41.33 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  42.48 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  44.6 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  40.99 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  42.66 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  43.61 
 
 		 139 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  42.76 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  41.84 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  38.31 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  39.01 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  36.77 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  38.51 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  37.68 
 
 		 161 aa  104  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  38.41 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  35.03 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  36.71 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  48.62 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  32.39 
 
 		 147 aa  98.6  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 		 144 aa  97.8  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 		 144 aa  97.8  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  39.19 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 		 144 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  38.51 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  94  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  38.69 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  37.41 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  37.41 
 
 		 144 aa  90.9  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  37.96 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  39.42 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  41.35 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  38.13 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  37.96 
 
 		 145 aa  88.6  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  38.69 
 
 		 145 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  37.96 
 
 		 145 aa  87.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  37.96 
 
 		 145 aa  87.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 		 145 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  35.21 
 
 		 146 aa  84.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  37.23 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  37.23 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  37.23 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  37.23 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  37.23 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  36.5 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  36.5 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33.58 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  39.29 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.58 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.89 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  33.59 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  40.38 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  33.91 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  31.58 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  36.9 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  38.32 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  32.82 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  30.66 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  28.93 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  36.46 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  34.91 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  37 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  30.56 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  30.93 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  34.94 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  31.54 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  27.56 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>