More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1093 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 132 aa  273  5e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  39.52 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  40.65 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  40.48 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  38.46 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  37.29 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  38.14 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  42.22 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  36.59 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  36.28 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  38.79 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  32.48 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  44.19 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  34.78 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  34.78 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  34.78 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  38.32 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  36.21 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  36.21 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  37.11 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  33.91 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  29.23 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 159 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  32.17 
 
 		 159 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  32.5 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  36.08 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  32.48 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  33.04 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  33.04 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  33.04 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  33.04 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  33.04 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  33.04 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  33.04 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  29.81 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  35.05 
 
 		 169 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  29.51 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  29.66 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  36.08 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0759  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  35.42 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  36.89 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  27.19 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  32.03 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  32.2 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  28.93 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  32.03 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  27.19 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  26.79 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  28.45 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 138 aa  52  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  38.27 
 
 		 199 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 232 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  27.56 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  38.27 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  38.27 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  34.04 
 
 		 209 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  38.27 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>