More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1780 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  68.49 
 
 		 147 aa  216  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  50.35 
 
 		 145 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  50.35 
 
 		 145 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  50.35 
 
 		 145 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3025  thioesterase superfamily protein  53.28 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0281155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  48.59 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  51.09 
 
 		 144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  47.18 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  32.14 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  29.29 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  26.35 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  29.82 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  28.35 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  30.97 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  24.78 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  27.59 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.13 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  28.45 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  28.83 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  31.62 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  31.85 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  30.39 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  26.79 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.27 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.43 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  27.08 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  24.44 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  27.08 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  28.15 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00564  hypothetical protein  32.74 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3029  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.99639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  32.74 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  32.63 
 
 		 145 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00553  hypothetical protein  32.74 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3047  hypothetical protein  32.74 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0617  hypothetical protein  32.74 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0499  hypothetical protein  32.74 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  32.74 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  26.09 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.73 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  29.85 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  27.27 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  26.15 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  26.77 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  25.71 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1486  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0682  hypothetical protein  32.74 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  24.77 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  31.13 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  32.17 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  26.67 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  24.21 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  33.62 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  26.67 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  28.37 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  26.43 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  30.4 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  31.13 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  30.77 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  28.78 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0757  hypothetical protein  32.54 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  30.15 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>