128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3502 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 140 aa  278  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  41.23 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  39.5 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  36.52 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  40.86 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  29.41 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  34.96 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  33.04 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  33.91 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 		 128 aa  57  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  34.38 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  35.43 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  27.78 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  33.33 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  24.26 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  26.98 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.82 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  23.26 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  30.7 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  22.83 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  29.7 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  28.69 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  33.65 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  34.15 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  34.15 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  34.15 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3579  hypothetical protein  30.83 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  28.85 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  40.74 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  29.67 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  29.51 
 
 		 209 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 232 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  31.3 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11875  hypothetical protein  30.09 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0963448  normal  0.270095 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1959  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  32.46 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  30.25 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  36.46 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  30.61 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  28.04 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  28.04 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  28.04 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  28.04 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  28.04 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 159 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  28.16 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  29.41 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  27.52 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  28.04 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  28.04 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  28.04 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3355  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.402541  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 		 213 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  29.6 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  31.54 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3025  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0281155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 170 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1582  phenylacetic acid degradation-like protein  27.87 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000511967  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  28.04 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>