More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5253 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  355  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 176 aa  355  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  51.93 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  50.59 
 
 		 232 aa  174  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  50.3 
 
 		 225 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  55.41 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  50.32 
 
 		 176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 184 aa  160  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  48.45 
 
 		 183 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  45.22 
 
 		 181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  43.12 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  42.31 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  37.34 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  45 
 
 		 169 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  44.2 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  40.52 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  44.14 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  38.82 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  46.76 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  46.04 
 
 		 146 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  39.76 
 
 		 187 aa  120  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  43.48 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  45.11 
 
 		 139 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  41.43 
 
 		 189 aa  117  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  40.52 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  41.01 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  40.28 
 
 		 161 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  41.5 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 		 144 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  38.85 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  38.85 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  38.85 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  41.13 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  35.97 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  39.49 
 
 		 165 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  37.41 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  40.94 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  37.32 
 
 		 160 aa  98.6  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  36.03 
 
 		 179 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  33.57 
 
 		 145 aa  97.8  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  36.76 
 
 		 179 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  36.23 
 
 		 146 aa  97.4  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  40.29 
 
 		 145 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  38 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  40.29 
 
 		 145 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  40.29 
 
 		 145 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  40.29 
 
 		 145 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  43.22 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  38.67 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  38.57 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  39.57 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  35.25 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  38.85 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  37.41 
 
 		 145 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  39.57 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  39.57 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  39.57 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  39.57 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  39.57 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  39.45 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  39.57 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  38.85 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  33.61 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  30.53 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  35.85 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  36.21 
 
 		 132 aa  62  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  28.66 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  37.61 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  38.61 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  32.48 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  32.11 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0284  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.719156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  28.24 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  26.71 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>