222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1240 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 
139 aa  286  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  78.52 
 
 
187 aa  230  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  70.9 
 
 
189 aa  207  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  70.15 
 
 
185 aa  198  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  69.4 
 
 
182 aa  197  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  65.67 
 
 
204 aa  191  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  62.69 
 
 
182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  62.69 
 
 
193 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  60.45 
 
 
182 aa  177  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  60.9 
 
 
179 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  57.97 
 
 
179 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  59.7 
 
 
189 aa  167  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  52.55 
 
 
169 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  49.64 
 
 
169 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  48.87 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 
176 aa  137  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 
181 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  51.49 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 
184 aa  131  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  53.72 
 
 
159 aa  131  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  51.15 
 
 
160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  50.38 
 
 
167 aa  124  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  42.86 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  46.97 
 
 
145 aa  121  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  47.73 
 
 
165 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  46.97 
 
 
145 aa  121  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  42.11 
 
 
161 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 
146 aa  121  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 
145 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  47.73 
 
 
145 aa  120  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 
145 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 
145 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
144 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  45.11 
 
 
176 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  45.11 
 
 
176 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  47.73 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  43.61 
 
 
170 aa  117  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 
144 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 
191 aa  114  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 
225 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  44.85 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  44.85 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  42.75 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  50 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  50 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  50 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  44.88 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  49.17 
 
 
174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  41.35 
 
 
146 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  49.15 
 
 
145 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  36.09 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  38.35 
 
 
145 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  41.41 
 
 
209 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
165 aa  94.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  46.39 
 
 
182 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 
191 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  38.64 
 
 
232 aa  90.5  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  40.46 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  34.13 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33.61 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  37.25 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  34.21 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  34.58 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  31.82 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  41.1 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  27.82 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  31.9 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
213 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  30.6 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  32.76 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  35.42 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  36.73 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
161 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
151 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  32.2 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 
134 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  33.71 
 
 
159 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  32.5 
 
 
176 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>