235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1780 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  352  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  64.24 
 
 
154 aa  189  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  51.37 
 
 
143 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  52.82 
 
 
146 aa  131  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  50.34 
 
 
154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  45.57 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  45.57 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  45.57 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  46.27 
 
 
144 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  48.92 
 
 
159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  48.2 
 
 
159 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  45.57 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  48.92 
 
 
159 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  47.44 
 
 
161 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  49.61 
 
 
161 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  50.39 
 
 
160 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  50.39 
 
 
160 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  50.39 
 
 
160 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  50.39 
 
 
160 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  50.39 
 
 
160 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  44.78 
 
 
144 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  44.78 
 
 
144 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  50.39 
 
 
160 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  50.39 
 
 
160 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  50.39 
 
 
160 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  51.11 
 
 
135 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  51.11 
 
 
147 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  47.69 
 
 
165 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  51.82 
 
 
148 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  51.09 
 
 
149 aa  121  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  51.08 
 
 
137 aa  121  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  52.27 
 
 
147 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  46.83 
 
 
154 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  41.09 
 
 
160 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 
157 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 
137 aa  88.2  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  37.66 
 
 
144 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
144 aa  88.2  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 
142 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  41.83 
 
 
146 aa  86.3  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  34.85 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  39.02 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  36.51 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
145 aa  72  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  36.89 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 
139 aa  62  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  36.29 
 
 
158 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 
191 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
161 aa  61.2  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  31.34 
 
 
149 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
161 aa  61.2  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 
131 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  35 
 
 
158 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  35.25 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  32.06 
 
 
155 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
165 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  34.35 
 
 
133 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 
181 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
127 aa  58.2  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  35.83 
 
 
187 aa  57.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  32.56 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  32.68 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  34.09 
 
 
127 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  36.36 
 
 
129 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  33.88 
 
 
127 aa  55.1  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  33.1 
 
 
238 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 
193 aa  54.3  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  33.56 
 
 
148 aa  54.3  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  32.58 
 
 
127 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  33.1 
 
 
248 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  28.79 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  33.1 
 
 
374 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  31.97 
 
 
143 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  33.79 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 
127 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
127 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  34.71 
 
 
129 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  33.1 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
127 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 
142 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  33.1 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  33.1 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 
139 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  32.98 
 
 
145 aa  52  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  30.95 
 
 
126 aa  51.6  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>